中国血吸虫病防治杂志 ›› 2023, Vol. 35 ›› Issue (4): 358-365,373.
杨振科1, 2*,王靖惠1, 2,齐一鸣1,田晓薇1, 2,梅雪芳1, 2,张振超1, 2,王帅1, 2*
YANG Zhenke1,2*, WANG Jinghui1,2, QI Yiming1, TIAN Xiaowei1,2, MEI Xuefang1,2, ZHANG Zhenchao1,2, WANG Shuai1,2*
摘要: 目的 采用生物信息学技术对刚地弓形虫RNA结合蛋白DDX39(TgDDX39)进行分析,评估该蛋白的免疫原性,从而为研发弓形虫病疫苗提供参考依据。方法 在ToxoDB数据库中检索TgDDX39氨基酸序列后,利用ProtParam、TMHMM 2.0、SignalP 5.0、NetPhos 3.1、COILS、SOPMA、Phyre2、ProtScale、ABCpred、SYFPEITHI、DNASTAR等生物信息学软件预测TgDDX39蛋白的理化性质、蛋白跨膜结构域、信号肽位点、翻译后修饰位点、卷曲螺旋、二级和三级结构、亲疏水性及抗原表位。结果 TgDDX39蛋白是一种不稳定亲水性蛋白,分子式C2173H3458N598O661S18,含有434个氨基酸,预测分子量为49.1 kDa,理论等电点为5.55。预测该蛋白存在信号肽的可能性极低,无跨膜区,并含有27个磷酸化位点;TgDDX39蛋白二级结构中β转角和无规则卷曲占39.63%,有1个部位有形成卷曲螺旋的倾向,且TgDDX39蛋白含有多个B、T细胞抗原表位。结论 生物信息学预测显示,TgDDX39蛋白具有高免疫原性、含有多种抗原表位,具有作为弓形虫病疫苗候选蛋白分子的潜力。
中图分类号: