中国血吸虫病防治杂志 ›› 2023, Vol. 35 ›› Issue (1): 22-.
陶香林，马飞，李政，阚心蕊，叶长江，孙恩涛*
TAO Xianglin, MA Fei, LI Zheng, KAN Xinrui, YE Changjiang, SUN Entao*
摘要： 目的 分析不同地理种群棕脊足螨（Gohieria fusca）遗传多样性和遗传分化。方法 自安徽省芜湖市（WH）、蚌埠市（BB）、亳州市（BZ）和浙江省嘉兴市（JX）等4个地区采集螨虫标本并筛选出棕脊足螨，采用PCR技术扩增棕脊足螨线粒体细胞色素b（cytochrome b, Cytb）和核糖体DNA内转录间隔区（internal transcribed spacer, ITS）基因并对扩增产物测序。采用Chromas 2和DNASTAR 1.00软件进行序列校对和拼接，采用DnaSP 5.10.00软件计算各种群单倍型多样性（Hd）、核苷酸多态性（Pi），应用MEGA 10.2软件包计算遗传分化指数（Fst）和基因流（Nm）。采用Arlequin 3.1软件计算Tajima’s D和Fu’s FS值，并进行中性检验和分子方差分析；采用Network 10.2软件基于Median⁃joining法构建单倍型网络图。结果 棕脊足螨样本Cytb基因序列长度为372 bp、ITS基因序列长度为1 301 ~ 1 320 bp。基于线粒体Cytb基因和核糖体ITS基因序列分析发现，4个棕脊足螨地理种群均表现出较高遗传多样性（Hd = 0.804，Pi = 0.006 91）。分子方差分析发现，4个棕脊足螨地理种群间存在遗传分化（Fst = 0.202 40, P < 0.05），且遗传变异主要来自种群内（79.76%）。基因流分析发现，4个棕脊足螨地理种群间局部存在高水平基因流（Nm > 1）。基于Cytb基因的中性检验发现，棕脊足螨WH种群Tajima’s D值和Fu’s FS值分别为-1.796 31和-3.293 98（P均< 0.05），表明WH种群可能发生过历史扩张。单倍型网络图和系统发育树分析结果一致，均表明不同棕脊足螨地理种群无明显地理分布格局。基于ITS基因序列分析发现，4个棕脊足螨地理种群单倍型多样性（Hd）与核苷酸多态性（Pi）均较高，整体值分别为0.985和0.011 97，具有较高遗传多样性。分子方差分析发现，棕脊足螨Fst值为0.104 62（P < 0.05），种群间存在中等程度遗传分化。基于ITS基因的中性检验发现，棕脊足螨整体Tajima’s D值和Fu’s FS值分别为-6.088 20和-1.935 99（P均> 0.05），无明显历史扩张。结论 4个棕脊足螨地理种群遗传多样性较高，存在显著遗传分化。由于不同棕脊足螨地理种群间局部发生高水平基因流，未发现其明显地理分布格局。
中图分类号:
苏公网安备32021102001651 苏ICP备11056399号-2
