CRISPR/Cas系统在病原体核酸检测中的应用进展

中国血吸虫病防治杂志 ›› 2023, Vol. 35 ›› Issue (1): 98-.

CRISPR/Cas系统在病原体核酸检测中的应用进展

李梦茹1，秦志强1，殷堃2，郑彬1*

1 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所（国家热带病研究中心）、国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室、WHO热带病合作中心、科技部国家级热带病国际研究中心、上海交通大学医学院⁃国家热带病研究中心全球健康学院（上海 200025）； 2 上海交通大学医学院

出版日期:2023-03-14 发布日期:2023-03-14
作者简介:李梦茹，女，硕士研究生。研究方向：寄生虫病监测与预警
基金资助:
国家重点研发计划项目（2021YFC2300800, 2021YFC2300803，2021YFC2300804）

Application of CRISPR/Cas systems in the nucleic acid detection of pathogens: a review

LI Mengru1, QIN Zhiqiang1, YIN Kun2, ZHENG Bin1*

1 National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Chinese Center for Tropical Diseases Research, National Health Commission Key Laboratory on Parasite and Vector Biology, WHO Collaborating Center for Tropical Diseases, National Center for International Research on Tropical Diseases, Ministry of Science and Technology, School of Global Health, Chinese Center for Tropical Diseases, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai 200025, China; 2 Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, China

Online:2023-03-14 Published:2023-03-14

摘要/Abstract

摘要： 快速、灵敏、特异的检测方法对于传染病防控至关重要。聚合酶链式反应、等温扩增等体外核酸扩增技术已广泛应用于病原体检测。近年来，基于规则成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白（CRISPR/Cas）系统的核酸检测方法显示出快速、高灵敏度、高特异性与便携性等优点。本文对CRISPR/Cas系统类型、原理及其在病原体检测中的应用进展进行综述，并对其应用前景进行展望。

关键词: CRISPR/Cas系统, 核酸检测, 病毒, 细菌, 寄生虫

Abstract: Rapid, sensitive and specific detection tools are critical for the prevention and control of infectious diseases. The in vitro nucleic acid amplification assays, including polymerase chain reaction and isothermal amplification technology, have been widely used for the detection of pathogens. Recently, nucleic acid detection⁃based on clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR⁃associated proteins (Cas) have been developed, which are rapid, highly sensitive, highly specific, and portable. This review describes the classification and principle of CRISPR/Cas systems and their applications in pathogen detection, and discusses the prospects of CRISPR/Cas systems.

Key words: CRISPR/Cas system, Nucleic acid detection, Virus, Bacterium, Parasite

中图分类号:

李梦茹, 秦志强, 殷堃, 郑彬. CRISPR/Cas系统在病原体核酸检测中的应用进展 [J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(1): 98-.

LI Mengru, QIN Zhiqiang, YIN Kun, ZHENG Bin. Application of CRISPR/Cas systems in the nucleic acid detection of pathogens: a review [J]. Chinese Journal of Schistosomiasis Control, 2023, 35(1): 98-.

[1]	夏菡, 袁志明. 70年来我国虫媒病毒发现分布与应对 [J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(5): 427-436,450.
[2]	姚丽熙, 林苏, 黄娇凤, 吴银莲. 1990—2030年我国乙型病毒性肝炎相关疾病的疾病负担分析及预测[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(5): 464-475,496.
[3]	周梅, 姚丽熙, 吴银莲, 林苏, 黄娇凤. 1990—2044年中国丙型病毒性肝炎相关疾病的疾病负担分析及预测[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(5): 476-485.
[4]	戴悦, 杨庆利. 寄生虫来源非编码RNAs及其跨物种调控作用和机制研究进展[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(5): 529-533.
[5]	马静阁, 刘宁, 刘紫嫣, 刘全, 魏峰, 王泽东. 我国致病性蜱媒病毒流行现状 [J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(4): 325-330,348.
[6]	刘颖, 王丹, 贺志权, 张滔, 燕慧, 林文, 张轩, 陆申宁, 刘玉婷, 王多全, 黎军, 阮卫, 李石柱, 张红卫. 新型冠状病毒感染疫情对我国输入性疟疾防控的影响 [J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(4): 383-388.
[7]	欧阳石, 翟延评, 冯瑞海, 熊娅莎, 余丽娜, 刘崇文. 输入性重症疟疾新型冠状病毒感染密接者1例 [J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(4): 421-423.
[8]	彭玉凤, 廖晓梅, 朱乐攀, 张扬南. 湖南省郴州市某医院就诊人群粪便样本寄生虫感染检测[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(3): 291-293.
[9]	曾婷, 贾铁武. 全球疾病负担研究方法学进展及其对寄生虫病疾病负担的影响[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(3): 299-306.
[10]	陈晓军, 周莎, 邱竞帆, 陈琳, 徐志鹏, 季旻珺, 郭静, 张戎. “虚实结合”实验教学新模式在《人体寄生虫学》教学中的应用——以“血吸虫综合实验”为例[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(2): 180-.
[11]	买买提江·吾买尔, 翟啸虎, 阿衣夏木·克尤木, 史光忠, 王蒴, 程侠, 凯迪亚·司马义, 赵江山. 新型冠状病毒肺炎流行期间新疆维吾尔自治区1例内脏利什曼病调查[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(2): 213-.
[12]	曾婷, 吕山, 田利光, 李石柱, 孙乐平, 贾铁武. 1990—2019年我国主要人体寄生虫病疾病负担变化趋势研究[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(1): 7-.
[13]	周霞, 李嫄渊, 夏超明. 过程化考核在留学生《人体寄生虫学》教学中的探索与实践[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2023, 35(1): 82-.
[14]	王依, 李成媛, 张嘉尧, 黄轶昕, 杨坤, 刘耀宝. 基于Delphi法构建居民预防寄生虫病健康素养指标体系[J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2022, 34(6): 616-.
[15]	周小倩, 马杰, 王睿怡, 王若航, 吴毅强, 杨欣宴, 陈玉娟, 唐小牛, 孙恩涛. 基于高通量测序的粉尘螨体内细菌多样性研究 [J]. 中国血吸虫病防治杂志, 2022, 34(6): 630-.